这个脚本可以自动化BLAT的运行。
提供以下功能：
- 提供打包后的并行运行功能。
- 监控所有节点上进程并在结束后更新log文件
- 通过生成ooc文件加快比对速度
- 所有中间文件被保存。单个任务的错误只学要重新提交单个包即可
适用：
- 主要适用cDNA对基因组注释的提速
- 可以指定包的数量；对于大的任务，可以拆分为更多的小包来提速。
- 通过修改system函数内的命令，可以应用于其他序列比对软件的提速。
使用：
- 必须用nohup命令在login上提交（cluster的管理节点）。
- 使用>符来指定log文件的输出位置。
- 提交后可以关闭console，但必须在log文件输出Done making ooc file.。这个位置的功能尚需要改进。
经过测试，单个基因组水平（使用人，小鼠，水稻测试）的cDNA注释可以在20分钟内完成。
cpuinfo:
Intel(R) Xeon(R) Processor (Intel64 Harpertown)
===== Processor composition =====
Processors(CPUs) : 8
Packages(sockets) : 2
Cores per package : 4
Threads per core : 1
memory: 16G
