一个染色体的可视化

升级:增加了画着丝粒的功能。


做了一个染色体的可视化,可以用来显示染色体上特定区域的注释信息,如QTL,基因等等。

chr.js

如何使用

首先,你需要安装 Apache 服务器和 Php 环境在你的电脑上。

之后,用 git 把这个文件夹克隆到你电脑中网络文件存放的位置。

通过浏览器来(chrome, safari, 还是 firefox 根据你的喜好)访问 index.php 这个文件即可见可视化。

如果上面的步骤都成功了,你可以用自己的数据来替换 example_data 文件夹里的例子数据。

图片的例子显示了水稻染色体的SNP,数据集来源于第一个参考文献。

参考文献